报告题目:量子力学与分子力学结合方法在解析酶催化反应机制中的应用
报告人:刘永军(教授、博士生导师)
单位:山东大学化学与化工学院
报告摘要:2013年,美国科学家马丁·卡普拉斯、迈克尔·莱维特和亚利耶·瓦谢尔(Arieh Warshel)因发展了量子力学与分子力学相结合的QM/MM方法获诺贝尔化学奖。该方法既包括了量子力学的精准性,又利用了分子力学的高效性,在生物大分子体系模拟和酶催化反应机理解析方面得到了越来越广泛的应用。在本报告中,我们将介绍QM/MM方法的基本原理,以几类酶催化反应体系为例介绍QM/MM方法在机理解析中的应用。
报告人简介:1964年出生,理学博士,山东大学化学与化工学院教授,博士生导师;2006年入选中国科学院“百人计划”并获择优支持,2015年至今兼任英国皇家化学会RSC Advances杂志副主编。1985年毕业于曲阜师范大学化学系,获理学学士学位;1988年毕业于延边大学理学院,获理学硕士学位;2001年毕业于山东大学化学院,获理学博士学位,2001-2004在加拿大西蒙菲莎大学从事博士后研究。主要从事理论与计算化学领域的研究工作,擅长应用量子化学和分子模拟方法解析一些复杂化学反应或物理过程的微观机理,研究方向主要包括生物催化与仿生催化、特殊功能材料的结构-活性关系与理论设计等;在国际学术刊物J. Am. Chem. Soc,ACS Catalysis,Nature Communications等发表SCI论文150余篇,主持国家自然科学基金面上项目5项、科技部国家重点研发项目子课题1项、国防973项目子课题1项、其它省部级及企业委托项目近10项,已培养博士生20余人,硕士生10余人。
报告题目:酶的计算模拟与理性设计
报告人:盛翔(研究员、博士生导师)
单位:中国科学院天津工业生物技术研究所
报告摘要:酶催化反应机理是化学与生物学中的核心问题之一,基于物理建模的计算模拟,可以在原子和分子层面上理解酶促反应中结构和能量的变化规律,阐明酶的结构与功能关系、酶活性和选择性的调控机制,获取通过实验手段难以或者无法得到的微观信息,以指导实现酶的理性改造与从头设计,为生物合成技术的发展奠定重要的理论基础。报告将重点介绍团队在生物碱手性骨架合成酶、二氧化碳固定酶等体系催化机制的量子化学研究方面的工作进展,相关成果不仅在酶催化理论上取得了系列进展,也指导实现了多种酶的理性改造。
报告人简介:盛翔,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员、博士生导师,国家重点研发计划青年首席科学家,中科院人才引进计划入选者。2014年博士毕业于山东大学,随后赴瑞典斯德哥尔摩大学阿伦尼乌斯实验室从事博士后研究,并于2019年起任研究科学家职位,2021年加入中科院天津工业生物所,主要开展酶催化反应的多尺度计算模拟和新型人工酶精准设计方面的研究工作。近五年以第一或通讯作者在JACS(1)、Angew. Chem. Int. Ed.(2)、ACS Catal.(7)、Acc. Chem. Res.(1)等期刊发表20余篇SCI论文。主持国家级、省部级基金项目6项,任《ChemistryOpen》、《应用与环境生物学报》青年编委会成员和中国生物工程学会青委会成员。
报告题目:铁依赖氧化酶催化机理的理论研究
报告人:苏浩(研究员)
单位:中国科学院天津工业生物技术研究所
报告摘要:含铁氧化还原酶在众多生物质的合成与修饰中起关键作用,如Fe(II)/酮戊二酸依赖酶、P450酶可以高效的催化包括C-H活化,C-C断裂、羟基化、C-C偶联反应在内的多种不同反应,在生物制造领域具有广阔的应用前景。在原子层面上对酶催化机制的理解是指导酶的理性改造以解决天然酶对非天然底物活性低、选择性差、底物谱窄、稳定性差等问题基础。借助计算模拟方法可以对酶的酶催化反应机理进行详细研究,以明确在反应过程中起关键作用的残基,确定反应的决速步骤,定量研究选择性控制因素,针对性地提出提高酶活性和选择性的理性改造方案。本课题组使用计算模拟方法研究了几种催化不同类型反应的含铁酶体系,明确了相应酶催化反应机理确定了选择性调控机制,为相关酶的理性改造奠定了基础。
报告人简介:苏浩,博士,天津工业生物技术研究研究员。2017年于山东大学化学系获得博士学位。2017年至2021年先后到以色列耶路撒冷希伯莱大学、瑞典皇家理工学院做博士后研究。2021年10月加入天津工业生物技术研究所蛋白质计算模拟与设计研究组。主要研究领域为酶催化机理的理论研究及理性设计,主要研究内容是:利用分子动力学(MD)、量子力学与分子力学结合(QM/MM)及量子力学(QM)方法,对微观系统的物理化学性质进行理解,并对突变体性质进行理论预测。目前已在JACS, Angew.,ACS Catal.,JPCC,Inorganic,等期刊发表论文20余篇。
时间:2023年4月10日周一下午2:00-5:00
地点:济宁学院9号楼A118